A Secretaria Municipal de Saúde é composta pelos seguintes órgãos:

I – Secretaria Adjunta de Saúde:
II – Departamento de Planejamento e Gestão em Saúde:
  a) Gerência de Gestão, Contratos e Parcerias:
    1) Unidade de Apoio Administrativo e Suprimentos;
      i. Seção de Documentação e Atendimento ao Usuário;
      ii. Almoxarifado da Saúde;
    2) Unidade de Contas e Contabilidade;
    3) Unidade de Tecnologia de Informação;
    4) Serviço de Arquivo Médico e Estatística – SAME;
III – Departamento de Atenção Básica:
  a) Gerência das Unidades de Saúde [ESF e UBS]:
      i. Apoio Local à Gestão [ESF – Dr. João Cambauva];
      ii. Apoio Local à Gestão [ESF – Dr. Ulisses de Carvalho];
  b) Divisão de Vigilância em Saúde:
    1) Unidade de Vigilância Epidemiológica e Indicadores;
    2) Unidade de Vigilância Sanitária e Indicadores;
    3) Unidade de Fiscalização e Inspeção;
    4) Unidade de Controle de Vetores e Zoonoses;
IV – Departamento de Atenção Especializada e Hospitalar:
    1) Unidade de Gestão e Faturamento Hospitalar;
    2) Unidade de Manutenção Hospitalar;
    3) Serviço de Ambulância:
      i. Seção de Operação de Ambulâncias;
  a) Centro de Referência em Saúde do Trabalhador [CEREST].

Tal estrutura foi determinada pela Lei Complementar nº 178, de 18 de junho de 2025.