Bebedouro possui localização geográfica privilegiada. Situada na região Norte do Estado de São Paulo, faz parte da micro-região da Serra de Jaboticabal e da messo-região de Ribeirão Preto. Bebedouro limita-se com os seguintes municípios: ao norte Colina e Viradouro; ao sul, Pirangi e Jaboticabal; a leste, Pitangueiras e ao Oeste, Monte Azul Paulista.
Num raio que engloba até 150km encontram-se cidades que participam da economia e estão ligadas ao fluxo industrial e de transporte, como Ribeirão Preto, São José do Rio Preto, Franca, Barretos, Araraquara, Sertãozinho e Catanduva. E num raio de até 250km, estão grandes centros produtivos, como Campinas, Marília, Araçatuba e Uberlândia.
Existem três importantes rodovias que atravessam o município, por onde escoam a safra de diversos produtos:
A Rodovia Brigadeiro Faria Lima, pista dupla, é um dos caminhos para a capital paulista. Entre os 380 quilômetros que separam Bebedouro de São Paulo, encontram-se vários acessos a cidades do interior.
A Rodovia Comendador Pedro Monteleone dá acesso a cidade de Catanduva e à Rodovia Washington Luiz, para a chegada até São José do Rio Preto. Já a Rodovia Armando Salles Oliveira, interliga Bebedouro a Ribeirão Preto. Esses municípios são dois dos principais pólos comerciais do Estado. Ribeirão fica situada a 78 quilômetros e São José do Rio Preto a 108 quilômetros de Bebedouro, estando a cidade, portanto no centro da microrregião com 3 milhões de habitantes a 100km e num raio de 250km 12 milhões de habitantes, transformando a cidade num excelente centro de distribuição em logística. Outras rodovias vicinais facilitam o acesso a mais de 85 municípios.
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